全基因组关联分析-GWAS
通过对大样本量的全基因组进行测序,鉴定动植物基因组中重要基因型,并与关注的表型数据进行的关联分析进而找到与关注表型相关的位点,定位与性状相关基因。通过一次分析可以定位多个性状,为后续动植物的育种提供科学理论依据。
样本要求
样本量≥300,每个样本DNA≥1ug,OD值1.8-2.0之间
分析内容
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标准分析 |
质控及 SNP检测 |
数据质控 |
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序列比对 |
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SNP检测及基因分析 |
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全基因组关联分析 |
性状关联分析 |
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目标性状相关区域基因功能注释 |
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高级分析 |
群体分析 |
构建系统进化树 |
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群体主成分分析 |
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连锁不平衡分析 |
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群体多样性分析 |
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基因组重组分析 |
构建单体型图谱 |
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查找重组断点 |
分析周期
标准分析30天;标准分析+高级分析60天;